河海大學是國家首批授權授予學士、碩士和博士學位的高校之一。2016年教育部組織的學科評估中,學校水利工程學科獲評A+。“工程學”“環境/生態學”“計算機科學”“材料科學”學科進入 ESI 世界排名前 1%,擁有1個一級學科國家重點學科(水利工程),7個二級學科國家重點學科,2個二級學科國家重點學科培育點, 15個一級學科省級重點學科;15個博士后流動站;16個一級學科博士點,77個二級學科博士點;38個一級學科碩士點,205個二級學科碩士點;12種碩士專業學位類別,其中工程碩士專業學位涉及19個工程領域;56個本科專業。